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识别会增加患肺癌风险的罕见遗传变异

肺癌是美国男女癌症死亡的主要原因。虽然患这种疾病的风险可能受吸烟等环境和生活方式因素的影响,但研究估计有18%的肺癌病例是由于遗传遗传变异引起的。由贝勒医学院领导的新研究调查了遗传变异如何导致肺癌风险增加。

研究人员对来自八个大规模数据集的种系(遗传)DNA进行了完整的外显子组测序,包括1,045名有肺癌或早发性癌症家族病史的患者。这些群体更可能具有遗传风险变异。分析还包括885个控制案例。

研究的相应作者,医学-流行病学和人口科学教授,临床和医学研究所所长克里斯·阿莫斯(Chris Amos)博士说:“我们正在寻找对风险有相对较高影响但发生频率相对较低的变体。”贝勒的转化研究(ICTR)。“如果变异以低频出现,则必须查看许多不同的大型数据源来验证变异。这些结果可以在许多不同的欧洲人群中复制。”

研究人员确定了25个与肺癌易感性相关的罕见病原体新变种,并验证了其中五个变种。在这五个中,有两个变异体涉及与肺癌风险已知关联的基因,即ATM和MPZL2。三个变体涉及新型肺癌易感基因,POMC,STAU2和MLNR。该研究的第一作者刘彦宏博士表示,外显子组测序使研究人员能够鉴定出更多影响蛋白质和细胞功能的变异体。

调查插入或删除的贡献

“与单核苷酸变体相比,插入或缺失部分的DNA突变被研究不足,但是它们也很重要,因为它们会导致蛋白质被截断,”流行病学和人口科学医学助理教授,刘教授说。 Baylor的Dan L Duncan综合癌症中心。“在我们确定的25个候选变体中,三分之二是插入或缺失。”

为了进一步了解这些候选变体对细胞功能的影响,Baylor研究人员应用了内源性DNA损伤测定法,该方法可检测DNA中某些类型的突变的复制。他们假设肺癌风险基因导致细胞内源性DNA损伤的水平增加,导致基因组不稳定,并最终导致癌症。

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