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新的3D地图揭示了免疫细胞基因表达的内部运作方式

霍乱-COVID-19大流行凸显了我们微小的遗传差异如何对我们的身体对疾病的反应产生巨大影响。

拉霍亚免疫研究所(LJI)的讲师Vivek Chandra博士说:“差异就在我们体内。”“我们可以被相同的细菌或病毒感染,但是我们的疾病进展方式可能非常不同。”

遗传变异很重要,但还有更多的难题。为了真正了解基因如何影响健康,研究人员需要追踪控制基因在体内何时何地表达的开关(也称为“增强子”)。

现在,拉霍亚免疫研究所(LJI)的研究人员已经创建了增强子序列和基因如何在几种类型的免疫细胞中相互作用的3D图。他们在《自然遗传学》上的新研究为理解个体从哮喘到癌症的风险打开了大门。

新研究的共同作者,LJI副教授Pandurangan Vijayanand博士说:“没有人从技术上或分析上对免疫细胞的这种精确性进行这种定位。”

研究共同资深作者费哈特·艾伊(Ferhat Ay)博士,LJI计算生物学研究所所长助理教授,佐治亚州立大学的助理兼职教授说:“展望未来,我们可以应用该框架来理解许多不同疾病涉及的细胞类型。”加州大学圣地亚哥分校医学院。

这项工作于2020年12月21日发布,是LJI DICE顺式调节相互作用组项目的一部分。

DNA的隐藏玩家

我们中许多人被教导,细胞具有沿着遗传密码嗡嗡作响,“读取”基因并制造蛋白质的机制。但是在这个过程中,有两个关键的遗传角色扮演着隐藏的角色。

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