生物帮在全球发生COVID-19的大流行中，很难理解非洲以外的人为避免致命的埃博拉病毒病而多么幸运。感染后大量呕吐或腹泻使受害者丧失行为能力，约50%的受苦者因输液而死亡。埃博拉病毒仅通过体液传播，这标志着与COVID-19病毒的关键区别，这是一种有助于遏制埃博拉病毒传播的病毒。
埃博拉疫情在西非继续爆发，尽管2019年12月开发了疫苗并改善了护理和收容措施有助于控制埃博拉疫情。特拉华大学团队的超级计算机模拟包括XSEDE EMPOWER计划支持的一名本科生，这增加了混合能力，并有助于破解埃博拉螺旋形遗传材料的防御。这项新研究可能有助于导致治疗方面的突破，并为埃博拉和其他致命病毒性疾病(例如COVID-19)改进疫苗。
特拉华大学化学与生物化学系助理教授胡安·R·佩雷利亚说：“我们的主要发现与埃博拉核衣壳的稳定性有关。”Perilla与他人合着了一项研究，该研究于2020年10月发表在AIP化学物理学杂志上。它着重于核衣壳，一种蛋白质壳，可保护人体免受埃博拉病毒复制自身的遗传物质的防御。
“我们发现埃博拉病毒已经进化为通过与其核糖核酸，其遗传物质形成静电相互作用来调节核衣壳的稳定性，”佩雷利亚说。“ RNA与核衣壳之间存在相互作用，将其保持在一起。”
像冠状病毒一样，埃博拉病毒依赖于棒状和螺旋形的核衣壳来完成其生命周期。特别是，称为核蛋白的结构蛋白以螺旋排列的方式组装，以封装形成核衣壳的单链病毒RNA基因组(ssRNA)。
Perilla和他的科学小组的研究寻求了核衣壳稳定性的分子决定因素，例如ssRNA遗传物质的包装方式，系统的静电势以及螺旋装配中的残基排列。这些知识对于开发针对埃博拉的新疗法至关重要。然而，即使是世界上最好的实验实验室，这些见解仍然遥不可及。但是，计算机仿真可以而且确实可以弥补这一空白。
该研究的共同作者，紫苏实验室的本科生Tanya Nesterova说：“您可以将模拟工作视为实验工作的理论延伸。”她说：“我们发现RNA高度带负电荷，并通过与大多数带正电荷的核蛋白发生静电相互作用，帮助稳定了核衣壳。”
Nesterova于2019年通过XSEDE专家指导为工作，教育和研究提供生产奖学金(EMPOWER)奖学金获得了资助，该奖学金支持本科生参与XSEDE的实际工作。
