生物帮研究人员正忙于寻找可以有效抵抗病原体的药物。该病原体为严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)，通过其刺突蛋白与宿主细胞结合而感染，并与血管紧张素转化酶2(ACE2)受体连接。因此，穗-ACE2相互作用已成为抗病毒策略的主要目标。
2021年1月8日发表在《PLOSOne 》杂志上的一项新研究报道，从已经存在的药物库中鉴定出几种新肽，这些肽可用于抑制这种结合，因为它们对ACE2受体具有很高的特异性和结合亲和力。药物的重新利用具有多重优势。这是一种具有成本效益的方法，因为它处理的分子已经通过各种剂量的安全性和功效测试。其次，这些药物的商业生产制造过程已经到位。这些也可以更广泛地获得，从而可以立即进行更大访问。
ACE2受体是一种糖蛋白，位于几种类型的细胞膜上。它的N末端结构域(NTD)和催化位点面向细胞外空间，使其附着并代谢几种肽。SARS-CoV-2突突蛋白在C端结构域(CTD)中具有一个插入环，该环具有受体结合结构域(RBD)。早期SARS-CoV的RBD中，SARS-CoV-2的CTD中以及宿主受体ACE2中存在结合残基，表明这些残基主要参与发现和开发有效的抗病毒药物以预防和治疗这种情况。
研究人员首先使用虚拟筛选方法搜索了上千种化合物，以检查它们与ACE2分子的穗状结合表面相互作用的能力。他们以可能阻止受体与病毒突突蛋白相互作用的构象归零了两个可能以高亲和力结合受体的肽。
科学家使用分子动力学(MD)模拟来模拟30个姿势中的肽相互作用，每个姿势都针对ACE2结合位点。MD研究可用于评估参与结合相互作用的蛋白质的柔韧性和稳定性。通过分子力学对这些姿势进行精炼，并使用合适的软件评估最后两个姿势的对接分数，并对其进行可视化。当已知受体和配体的结构时，发现分子对接研究对于预测受体的潜在结合配体非常有用。
