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研究人员开发了新的工具来解密手机对话

加州大学欧文分校的一个由生物学家和数学家组成的跨学科团队开发了一种新工具,可帮助破译细胞之间相互交流所使用的语言。

在今天发表在《自然通讯》上的一篇论文中,研究人员介绍了CellChat,它是一种计算平台,能够解码信号分子,这些信号分子在细胞之间传递信息和命令,这些信息和命令聚集在一起形成生物组织,甚至整个器官。

为了正确理解细胞为什么要执行某些操作并预测其将来的行为,我们需要能够倾听它们在彼此之间所说的话。数学和机器学习工具可以翻译此类消息。”

聂青,高级研究主任,校长兼加州大学尔湾分校数学与发育与细胞生物学教授

UCI共同作者,UCI发育与细胞生物学教授Maksim Plikus补充说:“就像在我们不断被信息轰炸的世界一样,所有细胞都会同时遇到很多分子词。”这样做取决于分子信息的稳定流动以及最响亮地听到哪些单词和句子。”

为了使用CellChat在细胞之间翻译分子信息,研究人员输入了单细胞基因表达,然后给出了有关给定组织或器官的信号通讯特征的详细报告。

“对于每个不同的小区组,CellChat会显示哪些重要信号正在发送给它们的邻居,以及哪些信号具有接收能力,” Plikus说。“作为细胞语言的解释者,CellChat为科学家提供了指导整个器官功能的信号传导模式的宝贵见解。”

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